———————阿笠博士的家中———————
“这么说，新一你目睹了一场犯罪交易后被别人喂了一颗药然后变小了？”说话的人是一个长着白花胡子和地中海的胖老头，此人正是工藤新一从小就认识的科学家——阿笠博士。而工藤的父母此时不在国内，唯一值得信赖的人只有阿笠博士和小兰了，但是他不想让小兰陷入危险，于是来找阿笠博士寻求帮助（阿笠博士：我真“屑屑”你的信任啊）。
“没错博士，如今我已经不能再使用工藤新一这个身份了，如果让他们发现我还活着，那么他们一定会来解决掉我的，甚至可能解决掉我身边的人。”工藤新一伸出自己的小手脸色沉重地说道。
“那你现在打算去哪呢？而且总得要有一个身份吧。”阿笠博士挠了挠头，他虽然是一个科学家，但是除了科学以外一窍不通。
此时阿笠博士家的门被敲响，两人猛然抬头看向门口，而门外传来小兰的声音：“阿笠博士，你在家吗？新一在你这里吗？”
糟了！阿笠博士和工藤新一两人脸色一变，工藤新一赶紧往书房躲去，而阿笠博士慢吞吞地去开门说道：“奥，是小兰啊，新一不在我这里呢。”
小兰在进门后就往书房内走去，阿笠博士想要拦住她，反而让小兰更加起疑。“咦，阿笠博士，你家怎么会有小孩子。”小兰看见变调的工藤新一，此时工藤已经带上没有镜片的眼镜进行伪装。小兰看着工藤顿时心生喜爱，这个小孩长得真可爱呢，“博士，这个孩子叫什么名字啊。”
一旁的博士冷汗直冒，他还没想好新一以后叫什么名字呢。而一旁的工藤脑子飞速转动，在瞄了一眼书架上的书后冒出一句：“柯南，江户川柯南。”他的名字取自他最爱的福尔摩斯的作者，柯南道尔。
而博士听后也赶紧说道：“这个孩子叫江户川柯南呢，是我远房亲戚的孩子，他的父母把他交给我来抚养了。”说完后阿笠博士又想到小兰的父亲毛利小五郎是一个侦探，虽然是不入流的侦探，于是又说道，“小兰，你看我一个人也不好照顾小孩子，你帮我照顾他怎么样？”
一旁的小兰也不舍得拒绝博士的请求，再说她不知道为什么对柯南也有一种亲近感，于是便答应了下来。
从此，日本警视厅的救世主，新时代的福尔摩斯——工藤新一住进了青梅竹马的家中。与此同时，工藤新一，不，应该说是江户川柯南打算利用毛利小五郎的侦探身份一边破案一边暗中寻找黑衣组织的线索。
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